Chemic School - Software untuk Kimia

Chemic School v3.5 adalah software edukasi yang membantu untuk belajar kimia. Dilengkapi dengan tabel periodik, molecular 3-D viewer, kalkulator, tabel konversi, kamus istilah kimia, dan masih banyak lagi.

Untuk cara penggunaan software ini teman-teman hanya tinggal menge-klik icon yang teman-teman pilih. Misal, teman-teman ingin belajar mengenai tabel peroidik dari unsur-unsur kimia, maka teman-teman pilih Periodic Table, maka akan muncul gambar seperti ini.

 

Yang jelas ketika ingin menjalankan software ini harus sesuai dengan crack yang disediakan supaya software ini bisa berfungsi secara optimal.

Teman-teman bisa mendownload disini.

Semoga bermanfaat ^^

Chemitorium, Editor Rumus Kimia untuk Membuat Tampilan Molekul 3D

 

Setelah keliling di dunia maya, ketemu lagi dengan software Chemitorium 3D. Software ini semoga bermanfaat untuk teman-teman yang gemar belajar kimia.

Chemitorium adalah sebuah aplikasi yang berfungsi sebagai editor untuk rumus kimia yang bisa digunakan untuk membuat tampilan molekul 3D.

Aplikasi ini memungkinkan teman-teman untuk menganalisa dan memvisualisasikan senyawa-senyawa kimia organik. Dengan menggunakan Chemitorium teman-teman bisa mengedit kembali rumus-rumus atau struktural formula dan memvisualisasikannya dalam bentuk 3D. Selain itu, hasil visualisasi dapat disimpan dalam bentuk file.

Untuk tutorialnya bisa dilihat disini.

Jika teman-teman ingin mengunduh dapat diklik laman ini dan ini.

Semoga bermanfaat ^^

Spartan '10

Spartan '10

Software kimia komputasi sangat banyak macam dan kegunaannya. Selama ini saya hanya menggunakan sebatas untuk pengajaran saya di kelas. Yang paling sering adalah untuk mengambar stuktur senyawa untuk memberikan gambaran sedikit lebih nyata dibandingkan hanya berbicara atau sambil mengimajinasikan di otak saja. Siswa yang belum menemukan bayangan imaginasinya tentu akan kesulitan memahami konsep kimia yang saya ajarkan.

Tujuan utama berbagai software kimia komputasi adalah untuk melakukan penelitian terkait kimia teori yang menunjang kimia eksperimen. Hanya saja untuk mendapatkannya harus membayar lisensi yang terbilang tidak murah. Kalau menggunakan software yang bajakan tentu hal ini melanggar etika dan bisa saja dikenai sangsi. Meskipun demikian kalau untuk pembelajaran sering kali kita masih bisa memanfaatkannya dengan berbagai keterbatasan.

Seolah berlomba melakukan revisi, modifikasi, serta peningkatan kemampuan dan daya dukung dengan berbagai perangkat keras untuk memenuhi tuntutan akurasi dan kekomplekan komputasi dalam sistem kimia. Seperti pada Spartan 10 ini. Kita bisa melihat fiturnya antara lain Spartan 10 memberikan dorongan kinerja dan banyak fitur baru dengan tetap menjaga kemudahan penggunaan Spartan yang tak tertandingi. Spartan memfasilitasi berbagai tugas kimia komputasi, termasuk pencarian konformasi, struktur, energi, sifat spektrum, dan mengukur kesamaan molekul 3-D.

Selengkapnya fitur Spartan 10:

• Peningkatan Kinerja – Spartan’10 mendukung chipset I7 baru dari Intel, dalam praktek ini akan memperluas fungsi paralel dengan core memory 8-shared, secara signifikan ini meningkatkan fungsionalitas Paralel Spartan.
• Tampilan diagram Energi Orbital
• potensial permukaan hidrida untuk menjelajahi selektivitas nukleofilik
• Extension of T1 thermochemical recipe untuk silikon dan fosfor
• Fitur Permukaan clipping memungkinkan visualisasi dalam model grafis terhitung
• Peningkatan struktur database dan pilihan pencarian reaksi
• Peningkatan kemampuan pencarian spektrum inframerah
• Tutorial, masalah, dan Wikipedia dapat diakses dari dalam Spartan
• Sifat molekul dan atom yang diperluas dan deskriptor HKSA (Hubungan kuantitatif struktur-aktivitas)
• Perhitungan dan tampilan spektrum Raman
• Pilihan tampilan spektrum NMR termasuk DEPT, HSQC, dan HMBC
• Peningkatan akurasi pergeseran kimia 13C NMR
• Data mining, analisis statistik dan plotting
• Akses ke Sparta Spectra dan Database sifat spektra IR dan NMR, sifat molekul dan atom dan deskriptor HKSA
• Tab berbasis visualisasi pilihan untuk membuka file yang beragam; kustomisasi Toolbar untuk ikon
• Pengimplementasian Paralel frekuensi HF (Hartree Fock) dan DFT (density functional theory) dan metode RI-MP2
• Pengimplementasian penuh untuk sistem komputer 64 bit.

Open Source EducationalTtools for 2014

Ada yang baru lagi nih untuk pendidikan.
Baca artikel lengkapnya disini.

Aplikasi Hyperchem

Hyperchem

 

ProgramHyperchem, merupakan program kimia aplikasi 32 bit, yang dikembangkan oleh HyperCube Inc, untuk sistem operasi Windows 95/98, Windows NT, Windows XP, Windows Vista, Windows 7 dan Linux. HyperChem merupakan program handal dari pemodelan molekul yang telah diakui mudah digunakan, fleksibel dan berkualitas, dengan menggunakan visualisasi dan animasi tiga dimensi hasil perhitungan kimia kuantum, mekanika dan dinamika molekuler, menjadikan HyperChem terasa sangat mudah digunakan dibandingkan dengan program kimia kuantum yang lain.

Program kimia menyediakan fasilitas pembuatan model tiga dimensi (3D), perhitungan mekanika molekuler dan mekanika kuantum (semiempiris dan ab initio), disamping itu tersedia pula database dan program simulate Monte Carlo dan molecular dynamic (MD).

Fasilitas yang disediakan oleh program standar ini adalah :

• Input Struktur dan Manipulasi (Structure Input and Manipulation)
• Display Molekul (Molecular Display)
• Kimia Komputasi (Computational Chemistry)
• Metode Komputasi (Computational Methods)

Input Struktur dan Manipulasi :

1. Mengambar molekul dengan program ini relatif sederhana. Pilih unsur dari tabel periodik, kemudian di click dan ditarik dengan mouse, dengan mouse kita dapat mengontrol rotasi di sekitar ikatan, mengatur stereokimia molekul dan mengubah struktur.
2. Dengan mouse-controlled tools kita dapat melakukan seleksi, rotasi dan translasi serta mengubah ukuran struktur. Setting pada menu harus dimodifikasi terlebih dahulu untuk mengontrol operasi dari tools.
3. Untuk mengkonversi struktur 2D menjadi struktur 3D dapat dikerjakan dengan Hyperchem’s model builder.
4. Penggunaan constraint terhadap struktur relatif mudah, kita dapat melakukan constraint terhadap panjang ikatan, sudut ikatan, sudut torsi dan juga terhadap atom yang diinginkan.

Display Molekuler (Molecular Display):

1. Pilihan rendering: ball and stick, fused CPK spheres dengan pilihanshading and highighting, juga vdw dots, cylinders dan overlapping spheres.
2. Ribbon rendering untuk protein backbones, dengan pilihan sidechain display.
3. 3D isosurfaces atau 2D contour plots untuk: muatan total, kerapatan muatan, orbital molekul, kerapatan spin, potensial elektrostatik (ESP), ESP dipetakan pada 3D charge density surface.
4. Pilihan isosurface rendering: wire mesh. Jorgensen-Salem, transparent dan solid surfaces, gouraud shaded surface.
5. Selama simulasi dapat ditampilkan rerata energi kinetik, energi potensial, energi total dan parameter molekul seperti panjang ikatan, sudut ikatan, dan sudut torsi.
6. Animasi mode vibrasi dari spektra IR

Kimia Komputasi :

Dengan HyperChem kita dapat mengeksplorasi model energi permukaan potensial secara klasik atau kuantum dengan single point, optimasi geometri atau perhitungan dalam mencari keadaan transisi, selain itu kita dapat juga mempelajari pengaruh gerakan termal dengan molecular dynamics, Langevin dynamic atau simulasi Metropolis Monte Carlo.

Jenis Perhitungan :

Terdapat beberapa tipe perhitungan, antara lain kalkulasi single point, optimasi geometri, frekuensi vibrasi, pencarian keadaan transisi, simulasi dinamika molekuler, simulasi dinamika Langevin dan simulasi Monte Carlo.

1. Perhitungan single point dapat digunakan untuk menentukan energi molekul dari struktur yang ditentukan (tanpa proses optimasi)
2. Perhitungan optimasi geometri menggunakan algoritma minimasi energi untuk mendapatkan struktur paling stabil. tersedia 5 algoritma minimasi.
3. Perhitungan frekuensi vibrational dimaksudkan untuk mencari mode vibrasi normal dari suatu struktur teroptimisasi. Spektrum teroptimasi dapat ditampilkan dan gerakan vibrasi yang berkaitan dengan transisi spesifik dapat dianimasikan.
4. Pencarian keadaan transisi dilakukan dengan menentukan struktur metastabil yang bersesuaian dengan keadaan transition menggunakan metode Eigenvector Following atau Synchronous Transit. Sifat-sifat molekulernya kemudian dapat dihitung, dua metode untuk melokasikan keadaan transisi diimplementasikan di dalam HyperChem 5.
5. Metode Eigenvector Following sangat cocok digunakan untuk prosses unimolekular atau setiap sistem molekular yang mode vibrasi naturalnya cengerung menuju ke suatu keadaan transition.
6. Metode synchronous transit khususnya berguna jika reaktan dan produk sangat berbeda, terdapat dua metodologi Synchronous transit yang diimplementasikan di dalam HyperChem yaitu Linear Synchronous Transit (LST) dan Quadratic Synchronous Transit(QST).

Simulasi Molecular dynamics menghitung trajektori klasik untuk sistem molekular. Waktu pemanasan, keseimbangan dan pendinginan dapat diterapkan dalam simulasi ini juga dapat digunakan untuk proses-proses yang bergantung pada perubahan waktu. Simulasi dapat dilakukan pada energi konstan atau temperatur konstan.

1. Langevin dynamic simulations untuk memodelkan secara implisit molekul-molekul pelarut.
2. Simulasi Monte Carlo Metropolis berguna untuk mengeksplarasi konfigurasi yang mungkin dari suatu sistem dalam keadaan keseimbangan dan menentukan sifat sistem yang dinyatakan sebagai harga rata-rata untuk seluruh sistem yang sudah berada dalam keadaan keseimbangan.

Hasil Perhitungan dengan HyperChem :

HyperChem dapat digunakan untuk menentukan berapa sifat struktur antara lain:

1. Stabilitas relatif dari beberapa isomer

2. Panas pembentukan
3. Energi aktivasi
4. Muatan atom
5. Beda energi HOMO-LUMO
6. Potensial ionisasi
7. Afinitas elektron
8. Momen dipol
9. Tingkat energi elektronik
10. Energi korelasi elektron MP2
11. Energi keadaan tereksitasi CI
12. Sifat dan struktur keadaan transisi
13. Energi interaksi non-bonded
14. Spektra serapan UV-VIS
15. Spektra absorpsi IR
16. Pengaruh isotop pada vibrasi
17. Spektra serapan IR
18. Efek collision pada sifat struktur
19. Stabilitas dari kluster

Simulasi :

1. Interaksi docking

2. Pengaruh temperatur pada gerakan molekul
3. Pengaruh pelarut pada struktur dan dinamika
4. Interaksi intermolekuar pada kluster

Soal-Soal Latihan

Download soal-soal latihan materi ikatan logam dan gaya antar molekul disini.

Semoga bermanfaat ^^

Paket Program Android untuk Pembelajaran

Setelah kita mempelajari Android SDK dan Android Developer Tools, lalu gunanya untuk apa?

ADT dapat digunakan untuk membuat paket program lho. Paket program tadi dapat bermanfaat untuk pembelajaran. Beberapa contoh paket program yang digunakan untuk aplikasi sudah saya upload di blog ini. Teman-teman bisa sekedar membacanya.

Lalu, apa saja isi dari paket program itu?

Banyak. 

Paket program bisa berisi materi-materi sekolah. Materi sekolah yang dikemas dalam media pembelajaran dengan diberi selingan musik dan video akan membuat kita merasa lebih betah jika harus belajar berlama-lama di depan komputer. 

Selain itu, tampilan yang menarik dan bisa "dibawa" kemana-mana membuat kita lebih mudah jika harus belajar. Karena kita bisa belajar dimana saja. 

Contoh tampilan paket program android:

Di dalam ADT kita juga bisa bebas bereksperimen dengan memasukkan video, musik, tampilan web dan bermacam-macam untuk memperindah dan membuat paket program pembelajaran kita lebih menarik.

Jika teman-teman penasaran seperti apa paket program itu, teman-teman bisa mendownload disini. Paket program tersebut berisi materi ikatan logam dan gaya antar molekul.

Semoga bermanfaat ^^